Forocanaricultura.com

Tengo una pareja de canarios totalmente amarillos
Y Han tenido 3 crías el caso es que todas las crías las 3
han nacido con una mancha en el plumaje negra-gris en el mismo lado en una lateral de la cabeza
todas en el mismo lado ¿Porqué?

Porque en el arbol genealogico de tu pareja de canarios amarillos hubo alguna vez un canario melanico y con el tiempo se ha "depurando" esa herencia melanica pero todavia sigue dando alguna sorpresa.
Lo que no sabria explicarte es por que la mancha sale en el mismo sitio a todas las crias, pero la genetica es asi

Otra duda más, el color de pluma que tienen cuando son pichones es el definitivo?
O se les oscurece cuando mudan?

A algunas gamas de canarios de color les cambia bastante el color de pichones a adultos como por ejemplo a los mosaico rojo que el plumaje de pichon es casi como un beige y luego son blancos y rojos.....pero en los amarillos normalmente no varia el color de pichon a adulto pero si hacen el efecto contrario al que dices tu y no se oscurece sino que el plumaje de los machos adultos es mas brillante que de pichones

Si te refieres a que si van a desaperecerle esas manchas , tengo que decirte que casi seguro que no, algunas veces, cuando estas son muy tenues, desaparecen o se ocultan en el subplumaje, pero no es lo normal, si son muy oscuras, casi seguro que permanecerán. El color de los canarios suele cambiar algo desde su nacimiento, pero no de una forma radical, solamente en los canarios de factor rojo (que nacen de una tonalidad amarillenta subida), después de administrales pigmentate cambian a un color más o menos fuerte dependiendo de su capacidad para asimilar los carotenos.
Saludos